Las especies que habitan en los lagos y ríos del Parque Nahuel Huapi interesantes para la pesca deportiva son:

Trucha arco iris (Oncorhynchus mykiss)
Origen: Costa oeste desde México hasta Alaska.
Es la trucha con mayor distribución en la Patagonia gracias a su alta capacidad de adaptación a distintas condiciones ambientales. Se distingue de los demás salmónidos por la ancha banda purpúrea que tiene en cada uno de sus flancos, desde el opérculo hasta la cola. Su espalda es verde oliva y sus lados plateados, tornándose blanca en el vientre. Presenta manchas negras redondeadas en todo el cuerpo, principalmente en el dorso. Las aletas dorsales y caudal están profusamente moteadas. La aleta anal puede presentar el borde externo blanco en las truchas que frecuentan los arroyos. Las truchas que viven en los lagos toman un color más oscuro en el dorso. Su dieta es muy variada, pero se alimenta principalmente de invertebrados.

Trucha marrón (Salmo trutta)
Origen: Europa y Asia occidental
Es la trucha que alcanza los mayores portes. Se caracteriza por su coloración dorada; con el dorso marrón, los flancos plateados y el vientre amarillento. Tiene pintas anaranjadas en los flancos y manchas muy notorias oscuras con un halo ligeramente más claro en los costados, hasta bien por debajo de la línea lateral, el dorso y los opérculos. Generalmente la aleta adiposa presenta una coloración anaranjada. La aleta caudal puede tener manchas pero son escasas. Tiene una alimentación muy variada y evidencia una enorme voracidad, capturando desde invertebrados a peces e incluso pequeños roedores.

Trucha de arroyo (Salvelinus fontinalis)
Origen: Costa oeste de EEUU y Canadá.
Es el más pequeño de los salmónidos patagónicos, habita en aguas más frías y es frecuente encontrarlas en las surgencias de aguas subterráneas Es la trucha más vistosa por su notable coloración. Presenta el dorso verde oliva con manchas vermiculadas de color amarillo verdoso. Las aletas pectorales, pélvicas, anal y caudal presentan el extremo anterior blanco con el borde negro y sobre sus flancos tiene pintas rojas muchas veces rodeadas por un habo azulado. En época de reproducción muchos ejemplares tienen el vientre de un color naranja fuerte y en ocasiones con manchas amarillas. Se alimenta de caracoles y de una gran variedad de invertebrados que pueblan los arroyos o caen accidentalmente al agua.

Salmón del Atlántico (Salmo salar)
Origen: Cuenca del Atlántico Norte.
Tiene una distribución muy restringida en la Patagonia, en la cuenca del río Limay se encuentra especialmente en el lago y río Traful, en el río Limay y en la presa Alicurá. Es un pez esbelto de gran belleza y el favorito de muchos pescadores por su combatividad. En proporción su cabeza es más chica que el cuerpo. El tronco y la cola son más finos, especialmente el pedúnculo caudal adelgazado que permite sujetarlo por éste. La aleta caudal es más ahorquillada, presenta una hendidura media. El dorso es azulado con manchas negras, algunas en forma de "x", aunque poco abundantes, no se observan en las aletas. No están rodeadas por un habo oscuro como en la trucha marrón.

Perca (Percichthys trucha)
Es nativa de las aguas patagónicas y ha resistido bien la introducción de los salmónidos.
Posee una aleta dorsal diferenciada en una parte anterior con espinas fuertes y punzantes y una parte posterior con radios blandos. Tiene escamas grandes, boca protráctil, el cuerpo es pardo dorado con manchas más o menos oscuras. Este color puede variar según el ambiente.

Pejerrey patagónico (Odontesthes hatcheri)
Es una de las más bellas especies de la región, de forma esbelta, muy hidrodinámica y fusiforme, más o menos comprimido lateralmente.
Posee dos aletas dorsales, la segunda no adiposa con radios, boca portráctil y una estola plateada en ambos flancos. Se alimenta básicamente con microcrustáceos grandes.